生物化學(xué)與分子生物學(xué)/蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)

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{{圖片|gra1jsp4.jpg|[[蛋白質(zhì)]][[三級結(jié)構(gòu)]]中某些次級鍵}}

圖1-8　蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)中某些次級鍵

蛋白質(zhì)的[[多肽]]鏈在各種[[二級結(jié)構(gòu)]]的基礎(chǔ)上再進一步盤曲或折迭形成具有一定規(guī)律的三維空間結(jié)構(gòu)，稱為蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)(tertiary structure)。蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定主要靠次級鍵，包括氫鍵、疏水鍵、[[鹽鍵]]以及范德華力(Van der Wasls力)等(圖1-8)。這些次級鍵可存在于一級結(jié)構(gòu)序號相隔很遠的[[氨基酸殘基]]的R基團之間，因此蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)主要指氨基酸殘基的[[側(cè)鏈]]間的結(jié)合。次級鍵都是非[[共價鍵]]，易受環(huán)境中pH、溫度、離子強度等的影響，有變動的可能性。[[二硫鍵]]不屬于次級鍵，但在某些肽鏈中能使遠隔的二個肽段聯(lián)系在一起，這對于蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定上起著重要作用。

現(xiàn)也有認為蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)[[分子]]主鏈折疊盤曲形成[[構(gòu)象]]的基礎(chǔ)上，分子中的各個側(cè)鏈所形成一定的構(gòu)象。側(cè)鏈構(gòu)象主要是形成微區(qū)(或稱[[結(jié)構(gòu)域]]domain)。對球狀蛋白質(zhì)來說，形成疏水區(qū)和親水區(qū)。親水區(qū)多在蛋白質(zhì)分子表面，由很多親水側(cè)鏈組成。疏水區(qū)多在分子內(nèi)部，由疏水側(cè)鏈集中構(gòu)成，疏水區(qū)常形成一些“洞穴”或“口袋”，某些輔基就鑲嵌其中，成為活性部位。

具備三級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)從其外形上看，有的細長(長軸比短軸大10倍以上)，屬于纖維狀蛋白質(zhì)(fibrous protein)，如[[絲心蛋白]]；有的長短軸相差不多基本上呈球形，屬于球狀蛋白質(zhì)(globular protein)，如[[血漿]][[清蛋白]]、[[球蛋白]]、[[肌紅蛋白]]，球狀[[蛋白]]的疏水基多聚集在分子的內(nèi)部，而親水基則多分布在分子表面，因而球狀蛋白質(zhì)是親水的，更重要的是，多肽鏈經(jīng)過如此盤曲后，可形成某些發(fā)揮[[生物學(xué)]]功能的特定區(qū)域，例如酶的活性中心等。

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